Chociaż leczenie kanałowe pod mikroskopem jest z reguły całkowicie dokładnym zabiegiem, czasami z powodu kolejnych stadiów chorobowych nieuniknione jest wznowione leczenie kanałowe (re-endo). W znacznej części takich sytuacji należy zdecydować się na próbę ponownego leczenia naturalnego zęba. Usunięcie zęba oznacza pojawienie się niekomfortowej luki, jaką powinno się wypełnić nie tylko ze względu na estetykę uzębienia. Brak zęba wywołuje stopniowy zanik kości, a także prowadzi do ruszania się obocznych zębów, jakim brakuje właściwego oparcia. Co więcej wypełnienie braku zęba skutkuje dodatkowym kosztem jakim jest wstawienie uzupełnienia protetycznego. Bez względu na to, czy zdecydujemy się na implant zęba czy na przykład most protetyczny, oznacza to kolejne wizyty w klinice stomatologicznej i ciągłe leczenie.
Z uwagi na to nawet kiedy dany ząb był już poddany leczeniu wcześniej, warto przemyśleć ponowne leczenie kanałowe. Choć ponowny zabieg, może być bardziej skomplikowany niż wcześniejszy, doświadczony dentysta endodonta, zrobi co w jego mocy, aby wykonać zabieg prawidłowo. Powtórne leczenie kanałowe przeprowadza się z reguły, jeśli znajdą się kanały niewyleczone za pierwszym razem, dlatego że na przykład nie zostały uprzednio dostrzeżone. Interwencja stomatologa endodonty niezbędna jest także w sytuacji perforacji korzenia lub komory zęba oraz kiedy w kanale złamało się narzędzie dentystyczne. Wyrwanie zęba przeważnie występuje tylko wtedy, jeśli nie ma możliwości prawidłowego opracowania kanału.